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单细胞测序文库制备——就用耶拿高速PCR
发布时间:2023/11/16
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世界上没有一模一样的两片树叶,世界上也没有一模一样的两个细胞。
对于多细胞生物来说,细胞与细胞之间是存在差异的,很多时候细胞基因组、转录组上的失之毫厘,在功能表现上却差之千里。
传统的测序,无论是一代的Sanger测序还是二代的NGS测序,都是在多细胞基础上进行的,得到的测序结果实际上是一堆细胞中信号的均值,丢失了细胞异质性(细胞之间的差异)的信息。
不同的异质或均质样本可能会获得相同的测序结果
单细胞测序,是在单个细胞水平上,对基因组(结构变异、拷贝数变异、单核苷酸变异等)、转录组(RNA表达水平、转录本的选择性剪接等)及表观基因组(DNA甲基化等)水平进行测序分析的技术。它能够检出混杂样品测序所无法得到的异质性信息,因此已经被越来越多地应用到了肿瘤研究,免疫学,发育生物学,神经科学,遗传学、细胞治疗,药物研发及动植物基础研究中。
单细胞测序的实验步骤主要可分为单细胞分离和裂解、测序文库制备、测序、数据分析几个部分,而在文库制备过程中,反转录、cDNA富集、加接头和标签、文库扩增等步骤,需要多次用到PCR仪,PCR仪的性能优劣对测序文库制备甚至是整个测序结果都有一定的影响。
作为单细胞测序技术领域的领头羊,10x Genomics公司的单细胞测序平台应用广泛,耶拿公司的高速PCR仪 Biometra TAdvanced 96 SG 经过 10x Genomics 公司的测试验证,已被列入 10x Genomics 公司推荐的适用PCR仪机型。
Biometra TAdvanced 96 SG 高速基因扩增仪
能为单细胞测序的文库制备提供稳定可靠的结果
镀金纯银样品槽,温度准确性± 0.1 ℃/s,温度均一性± 0.15 ℃/s,精准的温度控制带来更高的扩增效率以及文库制备的均一性;
适用的反应体积5-100 μl,满足单细胞测序文库制备的大体积扩增需求;
断电自动重启的样品保护功能,避免因意外停电导致的实验失败,这对于珍贵样品来说尤为重要。