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    DNA甲基化芯片

    DNA甲基化是最早被发现的表观修饰之一,能够通过影响染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式等,控制基因的表达。DNA甲基化修饰参与了多个生物学过程,包括细胞分化、胚胎发育、X染色体失活、组织特异性等,与癌症、衰老、老年痴呆、糖尿病等多种复杂疾病密切相关。

    售价:

    ¥ 0

    型号:

    DNA甲基化芯片

    DNA甲基化芯片

    品牌:

    SANGSHAI

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      • 商品名称: DNA甲基化芯片
      • 商品编号: DNA甲基化芯片
      • 品牌: SANGSHAI
      • 型号: DNA甲基化芯片
      • 质保期: -
      • 应用: 表观组服务
      • 类型: 其他
      • 国别: 中国

      DNA甲基化是最早被发现的表观修饰之一,能够通过影响染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式等,控制基因的表达。DNA甲基化修饰参与了多个生物学过程,包括细胞分化、胚胎发育、X染色体失活、组织特异性等,与癌症、衰老、老年痴呆、糖尿病等多种复杂疾病密切相关。

       

      一、产品简介

       

       

      甲基化芯片是研究DNA甲基化的一种常见手段,illumina推出新一代的InfiniumTM MethylationEPIC v2.0甲基化芯片是InfiniumᅠMethylationEPICᅠv1.0甲基化芯片的升级版本,与之前850K芯片相比,将位点增加到了935K。v2.0甲基化芯片移除了部分表现较差的探针,增加了大量的表观遗传前沿科学家或文章发表作者推荐的位点,主要包括靶向增强子、超级增强子、CTCF结合位点、CNV检测区域、通过ATAC-seq和ChIP-seq鉴定的开放染色质区域、850K甲基化芯片覆盖不足的CpG岛和常见癌症驱动突变。此外,935K甲基化芯片基因组版本更新至hg38,GenCode数据库更新到v41版本。

       

      二、产品特点

       

      · 覆盖大部分Infinium MethylationEPIC v1.0位点

      - CpG岛
      - 在人干细胞中发现的非CpG(CHH)甲基化位点
      - ENCODE开放染色质和增强子
      - FANTOM5 增强子
      - DNase超敏感位点
      - miRNA 启动子区域
      - > 85% HumanMethylation450 BeadChip content 在人干细胞中发现的非CpG(CHH)甲基化位点

       

      · MethylationEPIC v2.0 新增的探针位点:

      - 在多种癌症的肿瘤与正常样本中发现的差异甲基化位点
      - 通过ChIP-Seq在癌症和细胞系样本中鉴定的增强子和超级增强子
      - 使用ATAC-Seq在原发性人类癌症中识别的可及染色质区域
      - 扩大了CpG岛的覆盖范围
      - 增强了外显子的覆盖范围,实现更准确的拷贝数变异(CNV)检测
      - 常见的癌症驱动突变

       

       

      · 官方测试数据显示,普通样本和FFPE样本之间的显示出较高的技术重复性(高达98%),说明测序获得的甲基化水平信息具有很高可信度

       

       

      · 准确性高

      - 935K芯片具有高重现性、兼容性以及与测序数据的相关性

       

       

      实验流程

       

       

      样本要求: DNA≥0.5 μg ,浓度≥50ng/μ  物种: 人

      关键词:
      • DNA甲基化芯片

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