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    染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)是指通过染色质免疫共沉淀特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,然后对其进行纯化与文库构建,illumina高通量测序。通过数据与参考基因组比对,peak分析,可在全基因组范围内寻找目标蛋白特异性结合的DNA序列区段,可用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。

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    DNA甲基化是最早被发现的表观修饰之一,能够通过影响染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式等,控制基因的表达。DNA甲基化修饰参与了多个生物学过程,包括细胞分化、胚胎发育、X染色体失活、组织特异性等,与癌症、衰老、老年痴呆、糖尿病等多种复杂疾病密切相关。

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    核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位。核小体再折叠最终形成高度压缩的染色质结构。在复制和转录时高度折叠的染色质结构打开并暴露出DNA序列,这段DNA序列可被转录因子和其他调控原件结合,即染色质开放性。同时,这段裸露的DNA区域也是ATAC-SEQ需要研究的部分。

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    建库测序20个工作日,生信分析10个工作日

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