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    SBC lncRNA芯片

    SBC是国内最早从事基因芯片研发,也是最早的基因芯片外包服务商之一。SBC根据多年基因芯片开发、设计及对外服务经验,结合lncRNA分子特点,专门针对lncRNA研究设计了可同时检测lncRNA和mRNA的lncRNA+ 芯片产品以满足科学家的研究需求。芯片委托Agilent公司使用Agilent SurePrint技术生产,技术重复性高于99%。​​​​​​​

    售价:

    ¥ 0

    型号:

    SBC lncRNA芯片

    SBC lncRNA芯片

    品牌:

    SANGSHAI

    kg

    质保期:

    -

    kg

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      • S
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      • 商品名称: SBC lncRNA芯片
      • 商品编号: SBC lncRNA芯片
      • 品牌: SANGSHAI
      • 型号: SBC lncRNA芯片
      • 质保期: -
      • 应用: 生信分析
      • 类型: 其他
      • 国别: 中国

      SBC是国内最早从事基因芯片研发,也是最早的基因芯片外包服务商之一。SBC根据多年基因芯片开发、设计及对外服务经验,结合lncRNA分子特点,专门针对lncRNA研究设计了可同时检测lncRNA和mRNA的lncRNA+ 芯片产品以满足科学家的研究需求。芯片委托Agilent公司使用Agilent SurePrint技术生产,技术重复性高于99%。​​​​​​​

       

      一、产品简介



         SBC是国内最早从事基因芯片研发,也是最早的基因芯片外包服务商之一。SBC根据多年基因芯片开发、设计及对外服务经验,结合lncRNA分子特点,专门针对lncRNA研究设计了可同时检测lncRNA和mRNA的lncRNA+ 芯片产品以满足科学家的研究需求。芯片委托Agilent公司使用Agilent SurePrint技术生产,技术重复性高于99%。

       

       

      二、研究内容

       

      长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA,其在转录沉默、转录激活、染色体修饰、核内运输等均具有重要的功能。lncRNA曾被比喻为宇宙的暗物质,最近几年的研究发现它参与多种生物学过程,是维持基因功能的重要基础,与多种复杂疾病相关。但仍有大量lncRNA的具体作用机制尚不清楚,这也使得lncRNA成为当前的科研热点。

       

        基因芯片作为一个成熟的技术平台,二十几年来被广泛用于基因表达谱的检测。对于lncRNA基因表达谱检测,基因芯片比RNA测序有许多重要且不可替代的优势:

      ● 芯片利用寡核苷酸探针与目的基因碱基互补杂交、扫描获得的荧光信号来检测表达丰度。与RNA测序相比,芯片检测的准确性受低丰度转录本的影响更小,更适合检测整体表达丰度低的lncRNA。由于提高测序深度会增加加工不完全RNA的检出机率,提高测序深度可能引起可靠性的下降。

      ● lncRNA不具有蛋白的翻译起止位置,RNA测序对lncRNA转录本鉴定的可靠性要低于mRNA。而芯片探针较短可以进行特异性设计,检测更特异。

       

        SBC是国内最早从事基因芯片研发,也是最早的基因芯片外包服务商之一。SBC根据多年基因芯片开发、设计及对外服务经验,结合lncRNA分子特点,专门针对lncRNA研究设计了可同时检测lncRNA和mRNA的lncRNA+ 芯片产品以满足科学家的研究需求。芯片委托Agilent公司使用Agilent SurePrint技术生产,技术重复性高于99%。

       

      芯片设计策略:

       

        设计收录了相关数据库信息和高质量文献报道的lncRNA,去除冗余,并通过严格的生物信息学方法剔除lncRNA片段及不可靠的lncRNA。通过CAGE-seq,RNA-seq数据鉴定具有高可信度5’TSS及在多种组织或细胞中表达的lncRNA, HGNC收录及lncRNAdb收集的实验验证功能性的lncRNA作为高可信度lncRNA。基于earray软件设计探针,并利用SBC 自有分析流程对探针进行double-check,保证探针高特异性区分mRNA和lncRNA。

       

       

      芯片特点:

       

      ● lncRNA检测技术成熟、灵敏度高,芯片比测序更适合检测低表达量的lncRNA;

      ● 收录lncRNA全面、可靠,并及时更新;lncRNA注释全面、实用;

      ● 实验周期短,数据分析方法成熟、快速;

      ● 功能机制预测,为深入研究lncRNA生物学功能提供参考,包括:高保守lncRNA;lncRNA结合蛋白预测;lncRNA生物学功能预测;lncRNA亚细胞定位;疾病相关lncRNA预测;super enhancer lncRNA;enhancer lncRNA。

       

      芯片技术参数:

       

      物种

      芯片名称

      格式

      lncRNA transcripts

      Super enhancer lncRNAs

      coding transcripts

      数据库来源

      SurePrint G3 Human lncRNA Microarray

      4x180K

      93221

      22211

      27482

      NCBI、UCSC、Ensembl、Gencode、lncpedia、lncrnadb、dbSUPER、NONCODE

      小鼠

      SurePrint G3 Mouse lncRNA Microarray

      4x180K

      78264

      8024

      21611

      NCBI、UCSC、Ensembl、lncrnadb、dbSUPER、NONCODE、RNAcentral

       

       

       

       

       

       

       

       

       

       

      样本要求:RNA≥200 ng ;物种:人、小鼠

       

       

      关键词:
      • SBC lncRNA芯片

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