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    常规样本;建库测序20个工作日,生信分析10个工作日

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    SBC提供了深度空间蛋白质组技术,可进行高灵敏度的空间非靶向蛋白质组检测。该技术使用激光捕获显微切割技术(LCM)将组织切片(冷冻切片、FFPE)中的目标区域进行切割捕获,然后提取蛋白质,用4D质谱技术(timsTOF Pro)进行蛋白质组检测。

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    染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)是指通过染色质免疫共沉淀特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,然后对其进行纯化与文库构建,illumina高通量测序。通过数据与参考基因组比对,peak分析,可在全基因组范围内寻找目标蛋白特异性结合的DNA序列区段,可用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。

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    DNA甲基化是最早被发现的表观修饰之一,能够通过影响染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式等,控制基因的表达。DNA甲基化修饰参与了多个生物学过程,包括细胞分化、胚胎发育、X染色体失活、组织特异性等,与癌症、衰老、老年痴呆、糖尿病等多种复杂疾病密切相关。

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    核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位。核小体再折叠最终形成高度压缩的染色质结构。在复制和转录时高度折叠的染色质结构打开并暴露出DNA序列,这段DNA序列可被转录因子和其他调控原件结合,即染色质开放性。同时,这段裸露的DNA区域也是ATAC-SEQ需要研究的部分。

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    基因编辑是指对基因组中某一特定基因的DNA序列实现敲除、插入或替换的一种技术方法。

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    数字PCR(Digital PCR, dPCR) 基于泊松分布原理建立的一种核酸分子绝对定量技术。通过微滴发生器形成上万个微滴,其中每个微滴或不含或含有一个至数个核酸靶标分子。每个单分子进行PCR扩增,探针用于检测特定序列的靶标。随后逐个对每个微滴检测有无荧光信号,最终根据阳性微滴的比例,按照泊松分布的原理,通过软件计算出待检靶分子的拷贝数。

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    实时荧光定量聚合酶链式反应,使用荧光杂交探针,利用荧光信号累积监测PCR的扩增效率,用以精确定量起始模板数,通过内外参对特定DNA序列进行定量分析。

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    Simoa技术基于美国Quanterix公司研发的SimoaᅠHD-X数字式单分子免疫阵列分析仪,可以直接对血清和血浆等体液中的蛋白进行超高灵敏度检测。Simoa技术极大推动了疾病的早期检测、病情监控和辅助精准用药等,有助于提高患者生活质量、延长寿命。其主要应用于肿瘤、神经、感染性疾病、免疫炎症、生殖、眼科、心血管和制药等方向。目前全球引用该技术发表的文献超过2100篇,包括高分杂志Nature、NatureᅠBiotechnology、TheᅠLancetᅠNeurology、Nature Neuroscience、JAMA Neurology、The Journal of Experimental Medicine(JEM)等。

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    蛋白质印迹(Western Blot)又称为免疫印迹(Immunoblot),是根据抗原抗体的特异性结合检测复杂样本中的某种蛋白的一种分子生物学技术。该法是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的一种免疫生化技术。由于免疫印迹具有SDS-PAGE的高分辨力和固相免疫测定的高特异性和敏感性,现已成为蛋白分析的一种常规技术。Western Blot常用于鉴定某种蛋白,并能对蛋白进行半定量分析。

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    ELISA技术采用抗原与抗体的特异反应将待检物与酶连接,然后通过酶与底物产生颜色反应,用于定量检测。检测的对象可以是抗体也可以是抗原。

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    蛋白质印迹(Western Blot)又称为免疫印迹(Immunoblot),是根据抗原抗体的特异性结合检测复杂样本中的某种蛋白的一种分子生物学技术。该法是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的一种免疫生化技术。由于免疫印迹具有SDS-PAGE的高分辨力和固相免疫测定的高特异性和敏感性,现已成为蛋白分析的一种常规技术。Western Blot常用于鉴定某种蛋白,并能对蛋白进行半定量分析。

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    单细胞测序技术在2013年被 Nature Methods 评为年度技术,被Science评为年度六大生物类科研热点的首位,又在2015年登上Science转化医学封面。 Nature Methods 将2019年年度技术又给了单细胞多组学。2013年以来基于单细胞测序技术获得了多方面的研究进展,文献发表也呈现迅猛增长趋势。即使来源相同的单个细胞,由于随机生物过程和环境扰动的原因,彼此在许多方面也存在差异,即异质性。尤其是肿瘤细胞、免疫细胞、胚胎发育期细胞、干细胞等最为突出。常规的组学技术发现不了这一现象带来的影响,由此研究人员开启了单细胞测序技术的探索之路。

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    细胞间的信息交流(cell-cell communication)是通过配体与其受体相结合,引起特定细胞信号通路信号激活以及产生各种复杂的反应为基础。研究这些配体-受体相互作用对理解不同细胞类型间的细胞通讯网络及其参与的复杂生物学过程具有十分重要的意义。基于配体-受体的细胞互作分析是单细胞测序的高级分析之一。常用的细胞通讯分析软件:CellPhoneDB、CellChat。

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