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    RIP下游RNA建库测序 (3G)

    建库测序20个工作日,生信分析10个工作日

    售价:

    ¥ 0

    型号:

    RIP-seq-3G

    RIP-seq-3G

    品牌:

    SANGSHAI

    kg

    质保期:

    -

    kg

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    • 产品描述
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      • 商品名称: RIP下游RNA建库测序 (3G)
      • 商品编号: RIP-seq-3G
      • 品牌: SANGSHAI
      • 型号: RIP-seq-3G
      • 质保期: -
      • 应用: 生信分析
      • 类型: 其他
      • 国别: 中国

      建库测序20个工作日,生信分析10个工作日

       

      产品简介

       

      在真核生物中,RNA结合蛋白(RNA Binding Protein,RBP)种类繁多,在RNA剪切、转运、序列编辑、胞内定位及翻译控制等多个转录后调控过程中起着重要作用,因此了解RBP蛋白的功能对解开人类疾病有着重大意义。RNA Immunoprecipitation(RIP)作为研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具。利用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析,利用该技术有望发现多种RNA的调节靶点。

       

      服务优势

      ● 全转录组覆盖:可在全转录组范围对蛋白结合位点进行筛选与鉴定
      ● 高灵敏度:每个样本可获得数百万条的序列标签,检测转录本上更多的蛋白结合位点
      ● 高精确率:可获得高水平的信噪比数据,准确区分真实事件与噪音

       

      项目流程

      生物信息学分析项目

      测序类型 基本分析 高级分析
      RIP-seq测序
      (有参考基因组)
      1、 数据质量评估及QC
      2、 rRNA Reads过滤
      3、 参考基因组比对分析4、 唯一比对reads的分布统计5、 数据的可视化
      6、 结合峰检测7、 结合峰注释及统计

      8、 基因表达分析9、 结合峰的motif检测10、 共有及特有peak分析11、 差异结合峰检测


      12、 差异Peak相关基因KEGG通路富集分析(仅限于模式物种)
      13、 差异Peak相关基因GO富集分析


      (仅限于模式物种)
      1、 基因表达差异分析2、与其他测序数据关联分析

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