产品分类
- 产品描述
- 技术参数
- 配置清单
- 其他资料
-
- 商品名称: 外泌体全转录组测序(10G+10M)
- 商品编号: exosome AllRNA seq-10G
- 品牌: SANGSHAI
- 型号: exosome AllRNA seq-10G
- 质保期: -
- 应用: 生信分析
- 类型: 其他
- 国别: 中国
外泌体及其他微量、降解样本;建库测序20个工作日,生信分析10个工作日
一、产品简介
外泌体中携带有来自母本细胞的多种蛋白质、脂类、RNA等重要信息。对外泌体中的长链RNAs进行全转录组测序分析,一次测序实验,即可获得上万条长链RNAs的检测数据,全面覆盖 mRNA、lncRNA和 circRNA等长链RNAs。外泌体全转录组测序数据量大、信息全面,是发现特异性疾病诊断标志物、进行多组学分析的重要手段。同时,由于外泌体携带的长链RNAs中有超过70%为mRNA,外泌体全转录组测序的结果不仅可以进行深入的基因功能注释,而且还能够分析到外泌体可能来源的细胞类型及占比(即外泌体溯源)。

二、分析内容

三、经典案例:
血浆外泌体全转录组筛选胰腺癌标志物发现

2020年,复旦大学附属肿瘤医院研究团队从1mL血浆中分离外泌体,利用专利建库技术进行全转录组测序,成功筛选到了8种长链RNA,其形成的胰腺癌诊断标志物组合,比传统的CA19-9更加灵敏和特异。

外泌体全转录组测序结果显示:入组人群血浆外泌体中的mRNA普遍富集度最高,其次是LncRNA。随机森林等数据分析发现8种长链RNA在PDAC患者中普遍高于CP和HC组,可作为潜在诊断标志物。由8种长链RNA组成的标志物组合d-signature对于I.和II.期胰腺导管腺癌的诊断效能AUC 达到0.949, 远高于经典标志物CA19 -9 。联合d-signature和CA19-9诊断时,诊断效能进一步提高到AUC=0.964。
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